Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RFTN1Q14699 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms