Protein–RNA interactions for Protein: Q14690

PDCD11, Protein RRP5 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,871 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD11Q14690 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDCD11Q14690 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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