Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATMQ13315 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATMQ13315 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATMQ13315 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATMQ13315 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATMQ13315 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATMQ13315 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATMQ13315 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATMQ13315 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATMQ13315 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATMQ13315 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATMQ13315 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATMQ13315 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATMQ13315 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATMQ13315 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATMQ13315 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATMQ13315 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATMQ13315 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATMQ13315 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ATMQ13315 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATMQ13315 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATMQ13315 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATMQ13315 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ATMQ13315 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATMQ13315 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATMQ13315 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATMQ13315 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATMQ13315 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATMQ13315 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATMQ13315 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATMQ13315 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATMQ13315 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATMQ13315 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATMQ13315 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATMQ13315 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATMQ13315 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATMQ13315 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATMQ13315 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATMQ13315 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATMQ13315 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATMQ13315 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATMQ13315 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATMQ13315 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATMQ13315 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATMQ13315 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATMQ13315 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATMQ13315 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATMQ13315 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATMQ13315 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATMQ13315 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ATMQ13315 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATMQ13315 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATMQ13315 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ATMQ13315 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATMQ13315 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATMQ13315 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATMQ13315 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATMQ13315 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATMQ13315 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATMQ13315 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATMQ13315 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATMQ13315 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATMQ13315 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATMQ13315 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATMQ13315 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATMQ13315 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATMQ13315 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ATMQ13315 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATMQ13315 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATMQ13315 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATMQ13315 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATMQ13315 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATMQ13315 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATMQ13315 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATMQ13315 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATMQ13315 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATMQ13315 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ATMQ13315 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATMQ13315 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATMQ13315 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATMQ13315 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATMQ13315 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATMQ13315 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATMQ13315 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATMQ13315 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATMQ13315 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATMQ13315 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATMQ13315 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATMQ13315 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ATMQ13315 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATMQ13315 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATMQ13315 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATMQ13315 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATMQ13315 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATMQ13315 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATMQ13315 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATMQ13315 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATMQ13315 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATMQ13315 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATMQ13315 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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