Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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ERCC8Q13216 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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ERCC8Q13216 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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ERCC8Q13216 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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ERCC8Q13216 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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ERCC8Q13216 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERCC8Q13216 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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