Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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