Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
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TP53BP1Q12888 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
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TP53BP1Q12888 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
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TP53BP1Q12888 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TP53BP1Q12888 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
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