Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms