Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms