Protein–RNA interactions for Protein: P50991

CCT4, T-complex protein 1 subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT4P50991 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT4P50991 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT4P50991 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT4P50991 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT4P50991 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT4P50991 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT4P50991 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT4P50991 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT4P50991 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT4P50991 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT4P50991 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT4P50991 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT4P50991 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT4P50991 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT4P50991 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT4P50991 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT4P50991 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT4P50991 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT4P50991 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT4P50991 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT4P50991 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT4P50991 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT4P50991 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT4P50991 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT4P50991 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT4P50991 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT4P50991 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT4P50991 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT4P50991 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT4P50991 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT4P50991 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT4P50991 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT4P50991 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT4P50991 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT4P50991 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT4P50991 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT4P50991 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT4P50991 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT4P50991 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT4P50991 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT4P50991 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT4P50991 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT4P50991 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT4P50991 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT4P50991 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT4P50991 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT4P50991 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT4P50991 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT4P50991 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT4P50991 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT4P50991 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT4P50991 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT4P50991 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT4P50991 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT4P50991 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT4P50991 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT4P50991 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT4P50991 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT4P50991 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT4P50991 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT4P50991 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT4P50991 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT4P50991 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT4P50991 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT4P50991 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT4P50991 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT4P50991 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT4P50991 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT4P50991 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT4P50991 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT4P50991 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT4P50991 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT4P50991 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT4P50991 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT4P50991 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCT4P50991 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCT4P50991 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCT4P50991 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCT4P50991 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT4P50991 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT4P50991 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT4P50991 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT4P50991 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT4P50991 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT4P50991 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT4P50991 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT4P50991 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT4P50991 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT4P50991 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT4P50991 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT4P50991 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT4P50991 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT4P50991 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT4P50991 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT4P50991 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT4P50991 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT4P50991 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT4P50991 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT4P50991 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT4P50991 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms