Protein–RNA interactions for Protein: O60443

DFNA5, Non-syndromic hearing impairment protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFNA5O60443 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DFNA5O60443 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DFNA5O60443 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DFNA5O60443 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DFNA5O60443 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DFNA5O60443 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DFNA5O60443 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DFNA5O60443 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DFNA5O60443 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DFNA5O60443 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DFNA5O60443 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DFNA5O60443 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DFNA5O60443 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DFNA5O60443 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DFNA5O60443 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DFNA5O60443 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DFNA5O60443 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DFNA5O60443 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DFNA5O60443 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DFNA5O60443 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DFNA5O60443 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DFNA5O60443 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DFNA5O60443 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DFNA5O60443 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DFNA5O60443 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DFNA5O60443 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DFNA5O60443 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DFNA5O60443 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms