Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FOXO3O43524 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXO3O43524 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms