Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FANCAO15360 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCAO15360 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCAO15360 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCAO15360 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCAO15360 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCAO15360 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCAO15360 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCAO15360 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCAO15360 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCAO15360 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCAO15360 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCAO15360 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCAO15360 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCAO15360 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCAO15360 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCAO15360 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCAO15360 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCAO15360 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCAO15360 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCAO15360 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCAO15360 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCAO15360 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCAO15360 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCAO15360 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCAO15360 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCAO15360 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCAO15360 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCAO15360 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCAO15360 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCAO15360 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCAO15360 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCAO15360 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCAO15360 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCAO15360 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCAO15360 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCAO15360 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCAO15360 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCAO15360 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCAO15360 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCAO15360 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCAO15360 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCAO15360 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCAO15360 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCAO15360 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCAO15360 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FANCAO15360 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
FANCAO15360 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
FANCAO15360 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
FANCAO15360 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FANCAO15360 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FANCAO15360 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FANCAO15360 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FANCAO15360 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FANCAO15360 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FANCAO15360 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FANCAO15360 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FANCAO15360 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FANCAO15360 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FANCAO15360 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FANCAO15360 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FANCAO15360 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FANCAO15360 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FANCAO15360 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FANCAO15360 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FANCAO15360 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FANCAO15360 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FANCAO15360 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
FANCAO15360 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
FANCAO15360 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FANCAO15360 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC27■■□□□ 1.91
FANCAO15360 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FANCAO15360 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC27■■□□□ 1.91
FANCAO15360 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FANCAO15360 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FANCAO15360 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FANCAO15360 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FANCAO15360 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FANCAO15360 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC27■■□□□ 1.91
FANCAO15360 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FANCAO15360 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FANCAO15360 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FANCAO15360 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FANCAO15360 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FANCAO15360 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
FANCAO15360 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC27■■□□□ 1.91
FANCAO15360 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FANCAO15360 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FANCAO15360 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCAO15360 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCAO15360 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCAO15360 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCAO15360 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCAO15360 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCAO15360 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCAO15360 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCAO15360 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCAO15360 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCAO15360 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FANCAO15360 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms