Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPIPA5E9PKD4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms