Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
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ARL2-SNX15V9GYD0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
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ARL2-SNX15V9GYD0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
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ARL2-SNX15V9GYD0 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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ARL2-SNX15V9GYD0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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ARL2-SNX15V9GYD0 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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ARL2-SNX15V9GYD0 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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ARL2-SNX15V9GYD0 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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ARL2-SNX15V9GYD0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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ARL2-SNX15V9GYD0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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