Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms