Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI2

ATP8A2, Phospholipid-transporting ATPase IB, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A2Q9NTI2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP8A2Q9NTI2 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms