Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 GUSBP11-204ENST00000451837 3234 ntTSL 1 (best)16.91■□□□□ 0.32e-6■■■■■ 159.5
UTP3Q9NQZ2 GUSBP11-203ENST00000445682 3350 ntTSL 215.47■□□□□ 0.072e-6■■■■■ 159.5
UTP3Q9NQZ2 IFT122-204ENST00000349441 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.229e-7■■■■■ 159.5
UTP3Q9NQZ2 IFT122-213ENST00000506507 4532 ntTSL 512.47□□□□□ -0.419e-7■■■■■ 159.5
UTP3Q9NQZ2 IFT122-203ENST00000348417 3877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.619e-7■■■■■ 159.5
UTP3Q9NQZ2 IFT122-205ENST00000431818 4414 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.639e-7■■■■■ 159.5
UTP3Q9NQZ2 IFT122-210ENST00000504021 3541 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.659e-7■■■■■ 159.5
UTP3Q9NQZ2 IFT122-215ENST00000507564 3824 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.79e-7■■■■■ 159.5
UTP3Q9NQZ2 IFT122-225ENST00000512220 4057 ntTSL 210.25□□□□□ -0.779e-7■■■■■ 159.5
UTP3Q9NQZ2 IFT122-202ENST00000347300 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.779e-7■■■■■ 159.5
UTP3Q9NQZ2 IFT122-206ENST00000440957 4007 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.799e-7■■■■■ 159.5
UTP3Q9NQZ2 IFT122-201ENST00000296266 4151 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.799e-7■■■■■ 159.5
UTP3Q9NQZ2 PTDSS2-207ENST00000527479 520 ntTSL 521.99■■□□□ 1.113e-8■■■■■ 159.5
UTP3Q9NQZ2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.443e-7■■■■■ 159.4
UTP3Q9NQZ2 SLC37A4-206ENST00000525372 1388 ntTSL 1 (best)18.87■□□□□ 0.613e-9■■■■■ 159.4
UTP3Q9NQZ2 SLC37A4-211ENST00000529510 850 ntTSL 518.5■□□□□ 0.553e-9■■■■■ 159.4
UTP3Q9NQZ2 SLC37A4-218ENST00000638186 2074 ntTSL 514.83□□□□□ -0.043e-9■■■■■ 159.4
UTP3Q9NQZ2 SLC37A4-208ENST00000526275 2626 ntTSL 1 (best)13.26□□□□□ -0.293e-9■■■■■ 159.4
UTP3Q9NQZ2 SLC37A4-203ENST00000524428 1526 ntTSL 1 (best)12.01□□□□□ -0.493e-9■■■■■ 159.4
UTP3Q9NQZ2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.222e-7■■■■■ 159.4
UTP3Q9NQZ2 EIPR1-204ENST00000435721 672 ntTSL 320.32■□□□□ 0.842e-7■■■■■ 159.4
UTP3Q9NQZ2 EIPR1-203ENST00000406835 738 ntTSL 520.32■□□□□ 0.842e-7■■■■■ 159.4
UTP3Q9NQZ2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.722e-7■■■■■ 159.4
UTP3Q9NQZ2 EIPR1-205ENST00000441271 647 ntTSL 518.32■□□□□ 0.522e-7■■■■■ 159.4
UTP3Q9NQZ2 EIPR1-207ENST00000444776 594 ntTSL 418.11■□□□□ 0.492e-7■■■■■ 159.4
UTP3Q9NQZ2 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.442e-7■■■■■ 159.4
UTP3Q9NQZ2 EIPR1-208ENST00000455162 847 ntTSL 511.39□□□□□ -0.592e-7■■■■■ 159.4
UTP3Q9NQZ2 EIPR1-210ENST00000463662 757 ntTSL 311.04□□□□□ -0.642e-7■■■■■ 159.4
UTP3Q9NQZ2 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.436e-7■■■■■ 159.4
UTP3Q9NQZ2 SHQ1-202ENST00000444040 2844 ntTSL 217.25■□□□□ 0.356e-7■■■■■ 159.4
UTP3Q9NQZ2 SHQ1-203ENST00000463369 2065 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.846e-7■■■■■ 159.4
UTP3Q9NQZ2 SMYD3-209ENST00000470510 1042 ntTSL 59.74□□□□□ -0.851e-6■■■■■ 159.3
UTP3Q9NQZ2 SMYD3-201ENST00000366516 1863 ntTSL 1 (best)9.47□□□□□ -0.891e-6■■■■■ 159.3
UTP3Q9NQZ2 FANCA-221ENST00000566889 2201 ntTSL 1 (best)26.22■■□□□ 1.794e-18■■■■■ 159.3
UTP3Q9NQZ2 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.494e-18■■■■■ 159.3
UTP3Q9NQZ2 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.154e-18■■■■■ 159.3
UTP3Q9NQZ2 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.14e-18■■■■■ 159.3
UTP3Q9NQZ2 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.224e-18■■■■■ 159.3
UTP3Q9NQZ2 UNKL-206ENST00000402641 669 ntTSL 319.52■□□□□ 0.726e-7■■■■■ 159.3
UTP3Q9NQZ2 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.192e-7■■■■■ 159.3
UTP3Q9NQZ2 ATP2B4-203ENST00000357681 8968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.762e-8■■■■■ 159.3
UTP3Q9NQZ2 ATP2B4-204ENST00000367218 8918 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.022e-8■■■■■ 159.3
UTP3Q9NQZ2 ANKRD13A-204ENST00000547639 904 ntTSL 56.18□□□□□ -1.422e-7■■■■■ 159.3
UTP3Q9NQZ2 PRIM2-207ENST00000615550 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.084e-7■■■■■ 159.3
UTP3Q9NQZ2 UHRF2-206ENST00000469298 990 ntTSL 521.99■■□□□ 1.116e-13■■■■■ 159.2
UTP3Q9NQZ2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.096e-13■■■■■ 159.2
UTP3Q9NQZ2 UHRF2-204ENST00000461236 454 ntTSL 36.94□□□□□ -1.36e-13■■■■■ 159.2
UTP3Q9NQZ2 ACAP3-209ENST00000476572 819 ntTSL 516.88■□□□□ 0.291e-6■■■■■ 159.2
UTP3Q9NQZ2 ELL-204ENST00000596915 623 ntTSL 317.06■□□□□ 0.322e-7■■■■■ 159.2
UTP3Q9NQZ2 AGAP3-209ENST00000469901 582 ntTSL 320.9■□□□□ 0.947e-7■■■■■ 159.2
UTP3Q9NQZ2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.635e-7■■■■■ 159.1
UTP3Q9NQZ2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.515e-7■■■■■ 159.1
UTP3Q9NQZ2 PEX26-204ENST00000474897 2082 ntTSL 520.61■□□□□ 0.893e-11■■■■■ 159.1
UTP3Q9NQZ2 ELP3-218ENST00000524103 1914 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.611e-6■■■■■ 159.1
UTP3Q9NQZ2 ELP3-201ENST00000256398 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.71e-6■■■■■ 159.1
UTP3Q9NQZ2 ELP3-210ENST00000521015 3158 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.841e-6■■■■■ 159.1
UTP3Q9NQZ2 ELP3-204ENST00000518112 2059 ntTSL 29.63□□□□□ -0.871e-6■■■■■ 159.1
UTP3Q9NQZ2 ELP3-202ENST00000380353 3078 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.891e-6■■■■■ 159.1
UTP3Q9NQZ2 ELP3-219ENST00000537665 3053 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.931e-6■■■■■ 159.1
UTP3Q9NQZ2 ELP3-216ENST00000523687 1923 ntTSL 28.7□□□□□ -1.021e-6■■■■■ 159.1
UTP3Q9NQZ2 ELP3-205ENST00000519261 1924 ntTSL 28.57□□□□□ -1.041e-6■■■■■ 159.1
UTP3Q9NQZ2 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.343e-11■■■■■ 159.1
UTP3Q9NQZ2 TAPBP-239ENST00000476333 726 ntTSL 217.01■□□□□ 0.319e-7■■■■■ 159
UTP3Q9NQZ2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.112e-6■■■■■ 159
UTP3Q9NQZ2 DOCK9-214ENST00000479769 420 ntTSL 318.56■□□□□ 0.562e-6■■■■■ 159
UTP3Q9NQZ2 GRWD1-202ENST00000598711 881 ntTSL 317.31■□□□□ 0.364e-22■■■■■ 159
UTP3Q9NQZ2 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.114e-22■■■■■ 159
UTP3Q9NQZ2 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.382e-6■■■■■ 159
UTP3Q9NQZ2 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.182e-6■■■■■ 159
UTP3Q9NQZ2 SKIV2L-204ENST00000465703 4507 ntTSL 1 (best)17.28■□□□□ 0.363e-7■■■■■ 159
UTP3Q9NQZ2 SKIV2L-208ENST00000474839 3378 ntTSL 213.28□□□□□ -0.283e-7■■■■■ 159
UTP3Q9NQZ2 SKIV2L-201ENST00000375394 3894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.443e-7■■■■■ 159
UTP3Q9NQZ2 CAMSAP1-201ENST00000312405 6054 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.151e-6■■■■■ 159
UTP3Q9NQZ2 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.823e-8■■■■■ 158.9
UTP3Q9NQZ2 BSG-209ENST00000574970 570 ntTSL 422.88■■□□□ 1.251e-6■■■■■ 158.9
UTP3Q9NQZ2 CYBRD1-207ENST00000494587 549 ntTSL 418.64■□□□□ 0.572e-6■■■■■ 158.8
UTP3Q9NQZ2 CYBRD1-205ENST00000468308 763 ntTSL 317.1■□□□□ 0.332e-6■■■■■ 158.8
UTP3Q9NQZ2 CYBRD1-206ENST00000474182 465 ntTSL 516.04■□□□□ 0.162e-6■■■■■ 158.8
UTP3Q9NQZ2 CYBRD1-202ENST00000375252 3540 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.332e-6■■■■■ 158.8
UTP3Q9NQZ2 CYBRD1-201ENST00000321348 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.562e-6■■■■■ 158.8
UTP3Q9NQZ2 CYBRD1-203ENST00000409484 1493 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.272e-6■■■■■ 158.8
UTP3Q9NQZ2 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.471e-7■■■■■ 158.8
UTP3Q9NQZ2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.944e-7■■■■■ 158.8
UTP3Q9NQZ2 RALGDS-204ENST00000393157 3689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.664e-7■■■■■ 158.7
UTP3Q9NQZ2 BRD9-211ENST00000494422 449 ntTSL 36.74□□□□□ -1.332e-6■■■■■ 158.7
UTP3Q9NQZ2 TENM1-203ENST00000461429 415 ntTSL 38.39□□□□□ -1.078e-7■■■■■ 158.6
UTP3Q9NQZ2 ACTN1-220ENST00000556433 1259 ntTSL 323.96■■□□□ 1.432e-13■■■■■ 158.6
UTP3Q9NQZ2 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.42e-13■■■■■ 158.6
UTP3Q9NQZ2 SLC25A13-203ENST00000472162 568 ntTSL 417.06■□□□□ 0.322e-13■■■■■ 158.6
UTP3Q9NQZ2 ZBED1-205ENST00000515319 905 ntTSL 216.38■□□□□ 0.212e-13■■■■■ 158.6
UTP3Q9NQZ2 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.082e-13■■■■■ 158.6
UTP3Q9NQZ2 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.072e-13■■■■■ 158.6
UTP3Q9NQZ2 ACTN1-202ENST00000376839 2824 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.122e-13■■■■■ 158.6
UTP3Q9NQZ2 HEATR1-204ENST00000483073 654 ntTSL 313.85□□□□□ -0.192e-13■■■■■ 158.6
UTP3Q9NQZ2 ACTN1-201ENST00000193403 3779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.432e-13■■■■■ 158.6
UTP3Q9NQZ2 ACTN1-203ENST00000394419 3464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.542e-13■■■■■ 158.6
UTP3Q9NQZ2 MRPS21-202ENST00000614145 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.652e-13■■■■■ 158.6
UTP3Q9NQZ2 ACTN1-208ENST00000553370 605 ntTSL 310.48□□□□□ -0.732e-13■■■■■ 158.6
UTP3Q9NQZ2 ACTN1-215ENST00000555616 919 ntTSL 310.17□□□□□ -0.782e-13■■■■■ 158.6
UTP3Q9NQZ2 ACTN1-213ENST00000554508 585 ntTSL 49.23□□□□□ -0.932e-13■■■■■ 158.6
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 1237.3 ms