Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D3

ZYG11B, Protein zyg-11 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZYG11BQ9C0D3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZYG11BQ9C0D3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZYG11BQ9C0D3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZYG11BQ9C0D3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZYG11BQ9C0D3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZYG11BQ9C0D3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZYG11BQ9C0D3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZYG11BQ9C0D3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZYG11BQ9C0D3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZYG11BQ9C0D3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZYG11BQ9C0D3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZYG11BQ9C0D3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZYG11BQ9C0D3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZYG11BQ9C0D3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZYG11BQ9C0D3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZYG11BQ9C0D3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms