Protein–RNA interactions for Protein: Q96MT7

CFAP44, Cilia- and flagella-associated protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP44Q96MT7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CFAP44Q96MT7 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP44Q96MT7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP44Q96MT7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP44Q96MT7 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP44Q96MT7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP44Q96MT7 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP44Q96MT7 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP44Q96MT7 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP44Q96MT7 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP44Q96MT7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP44Q96MT7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP44Q96MT7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP44Q96MT7 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP44Q96MT7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP44Q96MT7 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP44Q96MT7 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP44Q96MT7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP44Q96MT7 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP44Q96MT7 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP44Q96MT7 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP44Q96MT7 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP44Q96MT7 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP44Q96MT7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP44Q96MT7 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP44Q96MT7 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP44Q96MT7 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP44Q96MT7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP44Q96MT7 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP44Q96MT7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP44Q96MT7 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP44Q96MT7 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP44Q96MT7 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP44Q96MT7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP44Q96MT7 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP44Q96MT7 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP44Q96MT7 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP44Q96MT7 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP44Q96MT7 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP44Q96MT7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP44Q96MT7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP44Q96MT7 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP44Q96MT7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP44Q96MT7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP44Q96MT7 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP44Q96MT7 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP44Q96MT7 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP44Q96MT7 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP44Q96MT7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms