Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VCPIP1Q96JH7 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms