Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY0

ZC2HC1A, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1AQ96GY0 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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ZC2HC1AQ96GY0 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZC2HC1AQ96GY0 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
ZC2HC1AQ96GY0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZC2HC1AQ96GY0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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