Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DNAAF3Q8N9W5 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms