Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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CLIP4Q8N3C7 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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CLIP4Q8N3C7 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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CLIP4Q8N3C7 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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CLIP4Q8N3C7 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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