Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB5

LIX1L, LIX1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIX1LQ8IVB5 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIX1LQ8IVB5 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIX1LQ8IVB5 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LIX1LQ8IVB5 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIX1LQ8IVB5 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIX1LQ8IVB5 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LIX1LQ8IVB5 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIX1LQ8IVB5 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIX1LQ8IVB5 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIX1LQ8IVB5 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIX1LQ8IVB5 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIX1LQ8IVB5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIX1LQ8IVB5 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIX1LQ8IVB5 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIX1LQ8IVB5 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIX1LQ8IVB5 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIX1LQ8IVB5 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIX1LQ8IVB5 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
LIX1LQ8IVB5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LIX1LQ8IVB5 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LIX1LQ8IVB5 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LIX1LQ8IVB5 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LIX1LQ8IVB5 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LIX1LQ8IVB5 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LIX1LQ8IVB5 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LIX1LQ8IVB5 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
LIX1LQ8IVB5 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LIX1LQ8IVB5 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LIX1LQ8IVB5 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIX1LQ8IVB5 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms