Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQC9

AKAP4, A-kinase anchor protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP4Q5JQC9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AKAP4Q5JQC9 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms