Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC92Q53HC0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms