Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
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TRIP13Q15645 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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TRIP13Q15645 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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TRIP13Q15645 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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TRIP13Q15645 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIP13Q15645 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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TRIP13Q15645 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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TRIP13Q15645 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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TRIP13Q15645 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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TRIP13Q15645 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
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TRIP13Q15645 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIP13Q15645 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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