Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAM2Q15035 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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