Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms