Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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