Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
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FOXF1Q12946 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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FOXF1Q12946 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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FOXF1Q12946 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
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FOXF1Q12946 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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