Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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