Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

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Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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