Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms