Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
PDE4DQ08499 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE4DQ08499 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms