Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMF1P82094 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMF1P82094 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMF1P82094 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMF1P82094 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMF1P82094 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMF1P82094 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TMF1P82094 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TMF1P82094 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMF1P82094 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMF1P82094 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMF1P82094 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMF1P82094 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TMF1P82094 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMF1P82094 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMF1P82094 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMF1P82094 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMF1P82094 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMF1P82094 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMF1P82094 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMF1P82094 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMF1P82094 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMF1P82094 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMF1P82094 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMF1P82094 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMF1P82094 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMF1P82094 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMF1P82094 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMF1P82094 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TMF1P82094 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMF1P82094 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMF1P82094 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMF1P82094 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMF1P82094 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMF1P82094 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMF1P82094 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMF1P82094 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMF1P82094 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMF1P82094 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMF1P82094 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMF1P82094 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMF1P82094 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMF1P82094 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMF1P82094 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMF1P82094 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMF1P82094 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMF1P82094 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMF1P82094 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMF1P82094 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMF1P82094 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMF1P82094 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMF1P82094 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TMF1P82094 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TMF1P82094 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMF1P82094 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMF1P82094 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMF1P82094 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMF1P82094 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMF1P82094 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMF1P82094 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMF1P82094 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMF1P82094 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMF1P82094 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TMF1P82094 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMF1P82094 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMF1P82094 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMF1P82094 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMF1P82094 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMF1P82094 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMF1P82094 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMF1P82094 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMF1P82094 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMF1P82094 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMF1P82094 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMF1P82094 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMF1P82094 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMF1P82094 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMF1P82094 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMF1P82094 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMF1P82094 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMF1P82094 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMF1P82094 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMF1P82094 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMF1P82094 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMF1P82094 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMF1P82094 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMF1P82094 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMF1P82094 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMF1P82094 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TMF1P82094 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMF1P82094 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMF1P82094 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMF1P82094 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TMF1P82094 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMF1P82094 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMF1P82094 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMF1P82094 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMF1P82094 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TMF1P82094 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMF1P82094 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms