Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
ERVS71-1P61550 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVS71-1P61550 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms