Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP107P57740 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP107P57740 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP107P57740 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP107P57740 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP107P57740 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP107P57740 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP107P57740 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP107P57740 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP107P57740 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP107P57740 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP107P57740 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP107P57740 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP107P57740 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP107P57740 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP107P57740 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP107P57740 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP107P57740 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP107P57740 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP107P57740 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP107P57740 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP107P57740 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP107P57740 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP107P57740 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP107P57740 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP107P57740 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP107P57740 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP107P57740 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP107P57740 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP107P57740 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NUP107P57740 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NUP107P57740 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NUP107P57740 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NUP107P57740 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NUP107P57740 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NUP107P57740 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NUP107P57740 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NUP107P57740 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NUP107P57740 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP107P57740 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP107P57740 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP107P57740 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP107P57740 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP107P57740 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP107P57740 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP107P57740 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP107P57740 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP107P57740 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP107P57740 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP107P57740 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP107P57740 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP107P57740 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP107P57740 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP107P57740 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP107P57740 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP107P57740 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP107P57740 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP107P57740 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP107P57740 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP107P57740 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP107P57740 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP107P57740 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP107P57740 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP107P57740 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP107P57740 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NUP107P57740 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP107P57740 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP107P57740 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP107P57740 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP107P57740 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP107P57740 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP107P57740 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP107P57740 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP107P57740 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP107P57740 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP107P57740 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP107P57740 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP107P57740 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP107P57740 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP107P57740 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP107P57740 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP107P57740 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP107P57740 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP107P57740 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP107P57740 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP107P57740 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP107P57740 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP107P57740 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP107P57740 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP107P57740 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP107P57740 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP107P57740 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP107P57740 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP107P57740 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP107P57740 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP107P57740 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP107P57740 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP107P57740 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP107P57740 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NUP107P57740 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms