Protein–RNA interactions for Protein: P56282

POLE2, DNA polymerase epsilon subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE2P56282 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLE2P56282 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLE2P56282 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLE2P56282 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLE2P56282 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLE2P56282 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLE2P56282 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLE2P56282 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLE2P56282 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
POLE2P56282 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLE2P56282 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLE2P56282 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLE2P56282 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLE2P56282 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLE2P56282 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLE2P56282 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLE2P56282 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLE2P56282 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLE2P56282 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLE2P56282 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLE2P56282 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLE2P56282 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLE2P56282 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLE2P56282 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLE2P56282 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLE2P56282 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLE2P56282 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLE2P56282 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLE2P56282 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLE2P56282 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLE2P56282 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLE2P56282 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLE2P56282 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLE2P56282 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLE2P56282 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLE2P56282 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLE2P56282 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLE2P56282 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLE2P56282 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLE2P56282 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLE2P56282 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
POLE2P56282 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLE2P56282 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLE2P56282 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLE2P56282 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLE2P56282 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLE2P56282 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLE2P56282 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
POLE2P56282 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
POLE2P56282 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
POLE2P56282 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLE2P56282 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLE2P56282 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLE2P56282 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLE2P56282 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLE2P56282 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLE2P56282 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLE2P56282 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLE2P56282 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLE2P56282 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLE2P56282 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLE2P56282 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
POLE2P56282 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
POLE2P56282 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLE2P56282 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLE2P56282 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLE2P56282 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLE2P56282 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLE2P56282 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLE2P56282 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLE2P56282 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLE2P56282 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLE2P56282 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLE2P56282 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLE2P56282 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLE2P56282 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLE2P56282 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLE2P56282 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLE2P56282 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
POLE2P56282 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
POLE2P56282 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLE2P56282 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLE2P56282 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLE2P56282 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLE2P56282 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLE2P56282 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLE2P56282 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLE2P56282 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLE2P56282 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLE2P56282 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLE2P56282 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
POLE2P56282 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLE2P56282 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLE2P56282 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLE2P56282 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLE2P56282 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLE2P56282 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLE2P56282 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLE2P56282 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLE2P56282 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms