Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKAA2P54646 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKAA2P54646 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKAA2P54646 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKAA2P54646 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAA2P54646 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAA2P54646 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAA2P54646 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAA2P54646 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAA2P54646 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAA2P54646 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAA2P54646 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAA2P54646 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAA2P54646 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAA2P54646 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAA2P54646 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAA2P54646 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAA2P54646 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAA2P54646 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAA2P54646 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAA2P54646 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAA2P54646 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAA2P54646 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAA2P54646 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAA2P54646 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAA2P54646 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAA2P54646 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAA2P54646 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAA2P54646 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAA2P54646 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAA2P54646 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAA2P54646 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAA2P54646 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAA2P54646 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAA2P54646 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAA2P54646 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAA2P54646 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAA2P54646 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAA2P54646 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAA2P54646 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAA2P54646 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAA2P54646 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKAA2P54646 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKAA2P54646 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKAA2P54646 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKAA2P54646 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKAA2P54646 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKAA2P54646 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKAA2P54646 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKAA2P54646 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKAA2P54646 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKAA2P54646 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKAA2P54646 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKAA2P54646 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKAA2P54646 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKAA2P54646 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKAA2P54646 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKAA2P54646 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKAA2P54646 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKAA2P54646 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKAA2P54646 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKAA2P54646 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRKAA2P54646 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRKAA2P54646 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRKAA2P54646 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRKAA2P54646 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRKAA2P54646 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKAA2P54646 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKAA2P54646 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKAA2P54646 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKAA2P54646 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKAA2P54646 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKAA2P54646 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKAA2P54646 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKAA2P54646 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKAA2P54646 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKAA2P54646 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKAA2P54646 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKAA2P54646 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKAA2P54646 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKAA2P54646 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKAA2P54646 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKAA2P54646 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKAA2P54646 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKAA2P54646 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKAA2P54646 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKAA2P54646 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKAA2P54646 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKAA2P54646 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKAA2P54646 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKAA2P54646 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKAA2P54646 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKAA2P54646 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKAA2P54646 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKAA2P54646 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKAA2P54646 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKAA2P54646 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKAA2P54646 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKAA2P54646 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKAA2P54646 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms