Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms