Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GTF2E2P29084 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2E2P29084 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms