Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP19O94966 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP19O94966 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
USP19O94966 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP19O94966 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP19O94966 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP19O94966 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP19O94966 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP19O94966 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP19O94966 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP19O94966 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP19O94966 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP19O94966 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP19O94966 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP19O94966 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP19O94966 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP19O94966 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP19O94966 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP19O94966 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
USP19O94966 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP19O94966 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP19O94966 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP19O94966 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP19O94966 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP19O94966 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP19O94966 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP19O94966 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP19O94966 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP19O94966 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP19O94966 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP19O94966 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP19O94966 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP19O94966 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP19O94966 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP19O94966 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP19O94966 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP19O94966 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP19O94966 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP19O94966 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP19O94966 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP19O94966 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP19O94966 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP19O94966 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP19O94966 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP19O94966 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP19O94966 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
USP19O94966 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP19O94966 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP19O94966 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP19O94966 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP19O94966 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP19O94966 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP19O94966 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP19O94966 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
USP19O94966 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP19O94966 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP19O94966 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP19O94966 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP19O94966 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP19O94966 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP19O94966 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP19O94966 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP19O94966 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP19O94966 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP19O94966 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP19O94966 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP19O94966 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP19O94966 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
USP19O94966 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP19O94966 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP19O94966 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
USP19O94966 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP19O94966 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP19O94966 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP19O94966 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP19O94966 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
USP19O94966 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP19O94966 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP19O94966 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP19O94966 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP19O94966 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP19O94966 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP19O94966 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP19O94966 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP19O94966 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP19O94966 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP19O94966 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP19O94966 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP19O94966 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP19O94966 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP19O94966 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP19O94966 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP19O94966 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP19O94966 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP19O94966 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP19O94966 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP19O94966 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP19O94966 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP19O94966 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP19O94966 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms