Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms