Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL9Q9P2J3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms