Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ7

UFSP2, Ufm1-specific protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP2Q9NUQ7 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFSP2Q9NUQ7 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms