Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BATF3Q9NR55 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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