Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TIMM29Q9BSF4 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms