Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 AC093581.1-204ENST00000442606 390 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 AL591767.1-201ENST00000557160 568 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 PSMG2-210ENST00000590217 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF12Q96QT6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms