Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PRAC1Q96KF2 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms